В связи с вступлением в силу с 1 января 2006 года основных положений Федерального закона Российской Федерации от 6 октября 2003 года № 131-ФЗ «Об общих принципах организации местного самоуправления в Российской Федерации» существенно изменилась структура администрации Янтиковского района, уменьшилась  штатная численность аппарата администрации.

На сегодняшний день утверждены положения о структурных подразделениях администрации района, распределены обязанности между работниками отделов, управлений и секторов по решению вопросов местного значения и осуществления отдельных государственных полномочий, возложенных на администрацию района в соответствии  с Уставом Янтиковского района.